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Jan 28, 2024

ブルカー、革新的な感度を備えたtimsTOF超質量分析計を発売

Di Heather Hall | 8 giugno 2023 Alla 71a conferenza ASMS Bruker Corporation

ヘザー・ホール著 | 2023 年 6 月 8 日

第 71 回 ASMS 会議で、ブルカー コーポレーションは、新しいプラットフォームの発売による 4D-プロテオミクス timsTOF プラットフォームの変革的な感度を発表しました。timsTOF 超質量分析計 。 これには、より大きな毛細管と最適化された渦ガス流を備えた新しいキャプティブ スプレー イオン化 (CSI) ウルトラ イオン ソース、新しい第 4 世代 TIMS (トラップ イオン モビリティ分離) XR セル、および 14 ビット デジタイザが組み込まれています。 のtimsTOF ウルトラは、1% FDR で 0.125 ng のタンパク質負荷の単一細胞レベルで 5000 のタンパク質グループにマッピングされる 55,000 を超えるペプチドを同定でき、20% 未満の CV で定量化された 4,800 を超えるタンパク質グループを識別できます。 この画期的な感度と 1 ng のタンパク質負荷レベル未満での定量性能は、新たなベンチマークを設定します。 timsTOF プラットフォームの実証済みの堅牢性と、MS/MS の PASEF デューティ サイクルが最大 300 Hz になった比類のない感度により、偏りのない単一細胞プロテオミクスや単一細胞リピドミクスなどの超微量サンプルのパフォーマンスが大幅に向上します。 、偏りのない空間プロテオミクス、免疫ペプチドミクス、リンプロテオミクス、PTM 解析、およびタンパク質間相互作用 (PPI) 研究。

「timsTOF Ultra の単一細胞感度 dia-PASEF ワークフローは、私たちの低入力組織プロテオミクス研究を新たなレベルに引き上げました。Bruker の最適化された dia-PASEF (3×8 ウィンドウ) メソッドと組み合わせた 20 分のナノフロー LC グラジエントの使用わずか 1,500 μm2 のマウス肝臓 FFPE 組織をレーザー顕微解剖し、約 1 ～ 2 個の肝細胞に相当する領域から 1,500 ～ 2,000 個のタンパク質を再現性よく定量できるようになりました」とマックス デルブリュック センターの空間プロテオミクスのグループリーダーであるファビアン コシア博士は述べています。 、ベルリン。

これらの timsTOF Ultra の進歩は、たとえば 1 日あたり 50 サンプル (SPD)、または最大 398 SPD のハイスループット プロテオミクスに対する優れた堅牢性や、<1% ペプチドおよび <1% ペプチドという最高の同定信頼性を損なうことなく達成されました。 % タンパク質 FDR (誤検出率) を実現し、標的免疫認識法で見られる交差反応性を回避します。

「細胞のメカニズムと疾患を真に理解するには、さまざまな細胞の種類を区別することが重要です。単一細胞分析は状況を一変させてきましたが、スループットと分析可能なタンパク質グループの可能性を最大化するには障害に直面しています。 timsTOF Ultra は、単一細胞実験で 6000 以上のタンパク質を検出する生物学的センスを備えており、timsTOF Ultra はこれらの障壁を克服し、個々の細胞のプロテオームを高速かつ比類のない感度で探索できるようになりました。新たな高みに到達しており、このブレークスルーが次にどこに私たちを導くのかを見るのが楽しみです」と、グレゴール・メンデル研究所（GMI）分子病理研究所（IMP）イノベーションハブのプロテオミクス責任者であるカール・メヒトラー教授は述べた。およびオーストリア科学アカデミー (IMBA) の分子生物工学研究所。

ブルカーさんも紹介ビスタスキャン TIMS ランプを四重極スキャンと同期させて、大規模なイオンモビリティ情報をさらに活用するためのソフトウェア。 この洗練されたダイナミックリンクランプは、斬新なシステムをサポートします。メディア-PASEFStefan Tenzer によって導入されたモード。

「私たちの研究室は、最高の感度と最高の情報抽出を必要とする定量的プロテオミクスの手法に焦点を当てています。Bruker と共同で、データに依存しない収集 (dia) の感度を提供する新しい最大情報 dia (midia) PASEF スキャニング収集モードを開発しました。ヨハネス・グーテンベルク大学マインツの定量プロテオミクス教授でMSコア施設長のステファン・テンツァー博士は、「データをデータ依存取得(dda)のようなスペクトルに変換しながら、免疫ペプチドミクスとリンプロテオミクスにおけるミディア-PASEFの可能性は特に興味深い」と述べた。 。

Bruker が独占的にライセンスを取得メディア-PASEFヨハネス・グーテンベルク大学マインツ出身、リリース予定メディア-PASEFtimsTOF Ultra には、必要な機能が装備されています。ビスタスキャン獲得能力。

さらに、timsTOF Ultra はさらに改良された dda-PASEF 取得モードを備えており、毎分最大 18,000 個の衝突断面積 (CCS) 対応 MS/MS スペクトルの速度を 300 Hz まで高め、詳細な 4D プロテオミクスと分析を可能にします。わずか数分の非常に短い LC グラジエントによる 4D-リピドミクス / 4D-メタボロミクス。